[Кирилл Юдин]

Версия крутится примерно вокруг этого:
1. Когда Путин пришел к власти, ему пришлось немного повоевать с олигархами. В результате пришли к соглашению - Путин "не видит" грехи приватизации, а нувориши-олигархи обеспечивают экономическую поддержку его реформ и, разумеется власти.
Таким образом, олигархи были выдавлены из власти, в обмен на договорённость, что их трогать за былые грехи не будут.
2. Поскольку вдохновителем, организатором и главным кормчим приватизации был Чубаис, его так же решено было не трогать. В противном случае придётся пересматривать итоги приватизации... короче это путь к гражданской войне, которая никому не нужна.
3. Скорее всего лично он миллиарды с этого процесса не поимел и по меркам олигархата не был состоятельным чиновником. Просто выбросить на свалку его так же было нельзя. Чтобы сидел тихо, ему обеспечивают безбедное существование за счёт высокооплачиваемых должностей. Его задача не лезть откровенно на рожон и не попадаться.
То есть ему обеспечили правовой иммунитет и достаток в обмен на тихое поведение.

Как известно, Путин своих договоров не нарушает. Даже договоров с мерзавцами. Поскольку одним махом у них всё не отнять, а учинив преследование, страна опустится в хаос, развал экономики в результате саботажа и бегства капитала + гражданская война. Без экономического базиса невозможно сделать ни одно хорошее дело государственного масштаба. Так что приходится искать компромиссы с дьяволом.