Надо было конвертить в avi и дальше VirtualDub бесплатный.
Может он и с mp4 работает если какие-нибудь плагины поставить.
Только в любом случае в меню видео надо выбрать direct stream при склейке, иначе он начнет все перегонять по полной программе, а это часы. А так склейка за пару минут.
Для мп4 есть MP4Box
является консольной программой, которая входит в состав проекта GPAC. Распространяется в исходниках. Для работы с ней нам понадобится графическая оболочка - Yamb. Скачать надо только версию с инсталлятором, т.к. она включает в себя скомпилированный MP4Box.
Тут есть инструкции по склейке и т.д.
http://rutracker.org/forum/viewtopic.php?t=2660545
Я даже когда-то этим пользовался - вставлял звуковую дорожку с переводом.